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美格基因|微生物多樣(yàng)性最新研究進(jìn)展20大地資源231027


發(fā)布時(shí)間:

2023-11-02

本期美格導讀為大家播報有關微生物多樣(yàng)性的研究前沿,如果大姐姐姐姐家想看本期任何一篇文章的詳細精讀,歡迎在下方給我們留言哦,我們將(jiāng)在後視頻高清版(hòu)期推文中為大家帶來詳細解讀~

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标題:Metaproteomics, metagenomics and 16S rRNA seq影院高清版uencing provide different persp直播姑娘ectives on the aerobic granular s直播姐姐ludge microbiome

譯名:宏蛋白質組學(xué)、宏基因組學(xué)和16S rRNA測序為好(hǎo)氧顆粒污泥動漫免費微生物組的研究提供了不同的視角

作者:Hugo B C Kleikamp等

時(shí)間:2023-10-06

期刊:Water Research

影響因子:12.8

DOI:10.1016/j.watres.2023.120700

 

 

摘要

測序技術的巨大進(jìn)步使DNA測序成(chéng)為微生物組研究的飄雪視頻常規方法。此外,質譜技術的進(jìn)步也將(jiāng)傳統的蛋白質組學(動漫成全xué)擴展到(dào)微生物生态學(xué)領域。然而,迫切需要國語飄雪進(jìn)行系統的研究,以更好(hǎo)地了解這(zhè)好姑娘直播些“組學(xué)”方法的互補性,特别是對(duì)于複雜的環境,如廢水處理污泥。在此,作者姑娘高清描述了來自三個不同污水處理廠的好(hǎo)氧顆粒污泥的比較代謝組學直播影院(xué)研究。為此,作者采用宏蛋白質組學(xué)、宏基因組測序和16S rRNA擴增子測序來GO美麗研究相同大小的顆粒材料。此外,作者進(jìn)一步使用基因組分飄雪TV類法數據庫(GTDB)對(duì)分類特征進(jìn)行了比較,以增強不同方法之間的可比性。姐姐直播雖然在不同的好(hǎo)氧顆粒污泥樣(yàng)品中鑒定出了一緻的主要分類群,但不同組學(x在線好姑娘ué)技術獲得的分類組成(chéng)在低分類水平上存在顯著差異,這(zhè)影響了好姑娘TV對(duì)營養物質去除過(guò)程的解釋。然而,正如宏蛋白質組學(xu影院大地é)所證明的那樣(yàng),在所有技術中一緻鑒定的屬涵蓋了大部分的蛋白質生物量。已建立的代謝美麗高清組學(xué)數據和contig分類流程已公開(kāi),這(zhè)為進(jìn)一步研GO美麗究好(hǎo)氧顆粒污泥的代謝過(guò)程提供了寶貴的資源。

 

推薦語

該研究對(duì)來自三個不同廢水處理廠的好(hǎo)氧顆粒污泥進(jìn)行了首次系統的宏在線影院組學(xué)研究,此外還(hái)比較了不同的參考序列數據庫,包括GTD中文版MVB、RefSeqNR、UniprotKB、MiDAS和SILVA。研究的數據證明了單一組學(大地丁香花xué)方法和數據庫如何偏向(xiàng)分類學(xué)和功能(néng)解釋。



 

标題:Validation of 16S rRNA gene姑娘MV sequencing and metagenomics fo視頻TVr evaluating microbial immigration in a metha中文版成全nogenic bioreactor

譯名:16S rRNA基因測序和宏基因組學(xué)評估産甲烷生物反應器中微生物遷移的驗證

作者:Tzu-Yu Lin等

時(shí)間:2023-07-15

期刊:Water Research

影響因子:12.8

DOI:10.1016/j.watres.2023.120358

 

 

摘要

為了定量評估來自上遊群落的微生物遷入對(duì)下遊群落微生影院免費物組裝的影響,建立了基于生态基因組學(xué)(ecogenomics飄雪影院)與16S rRNA基因測序相結合的質量平衡(EGMB)模型。本研究利用一個模拟群落高清版影院進(jìn)一步驗證了EGMB模型,并證明了使用基于宏基因組的動漫視頻EGMB模型來揭示微生物活性和功能(néng)的可行性。將(jiāng)由氣單胞菌、大腸MV藝術杆菌和假單胞菌組成(chéng)的模拟群落與溶解性有機底物一起(qǐ)投喂到飄雪直播(dào)實驗室規模的産甲烷生物反應器中。利用qPCR、16MV好姑娘S rRNA基因、16S rRNA基因拷貝數歸一化(GCN)影院資源和宏基因組分析,結果顯示飼料中的群落組成(chéng)具有高影院姐姐度可比性。在生物反應器中,氣單胞菌和假單胞菌在整個實驗過(guò)程中姐姐飄雪均呈負增長(cháng)。大腸杆菌的生長(cháng)速率在大多數生GOTV物标志物檢測中為負值,但在16S rRNA基因檢測中為正值。但随著(zhe)反應器運行姐姐TV時(shí)間的增加,所有處理方式的大腸杆菌生長(cháng)速率均呈負增長(cháng)趨勢。觀MVMV察到(dào)未培養的Desulfobacterota、Chloroflexi、影院國語Actinobacteriota和Spirochaetota種(zhǒng)群豐度增加,表明它視頻MV們對(duì)降解飼料生物量方面(miàn)的貢獻。根據宏基因組的代謝重構,這(zhè)些種視頻美麗(zhǒng)群具有水解、發(fā)酵、脂肪酸降解或乙酸鹽氧化等功能(néng)。總體而言,研究結視頻藝術果支持應用16S rRNA基因和宏基因組的EGMB模型來測量生物反動漫影院應器中微生物的生長(cháng)速度,後(hòu)者在深入了解未培養菌飄雪飄雪種(zhǒng)的微生物功能(néng)方面(miàn)具有優勢。

 

推薦語

該研究通過(guò)在EGMB模型中分别合并所有四種(zhǒng)生物标志物(即qPCR,1TV好姑娘6S rRNA基因,16S rRNA GCN和宏基因組)來評估三種(zhǒng)細菌菌株的特異性姑娘動漫生長(cháng)速率。使用宏基因組分析進(jìn)一步進(jìn)行代謝重構,以揭示生物反應GO影院器中活躍群體的潛在功能(néng)。結果表明,基于宏基因組的EGMB模型在表征微生物活性和微生物在大地成全全尺寸AD中的生态作用方面(miàn)具有巨大潛力。

 


 

标題:Integrating metabolomics, 16S rRNA sequen在線姐姐cing, network pharmacology, and metorigin to exp直播姐姐lore the mechanism of Cinnamomi Cortex in treat藝術資源ing chronic atrophic gastritis rats

譯名:結合代謝組學(xué)、16S rRNA測序、網絡藥理學中文版美麗(xué)和同源性研究肉桂皮治療慢性萎縮性胃炎大鼠的作用機制

作者:Yuetao Liu等

時(shí)間:2023-09-12

期刊:Phytomedicine

影響因子:7.9

DOI:10.1016/j.phymed.2023.155084

 

 

摘要

肉桂皮被(bèi)稱為肉桂(Rougui, RG),是一種(zhǒng)廣泛應用的藥食同源物。RGTV姑娘具有治療慢性萎縮性胃炎(CAG)的潛力,這(zhè)是一種(zhǒng)在中國(guó)人群中具有在線國語廣泛影響的疾病。 本研究基于UHPLC-Q/TOF MS(超好姑娘影院高效液相色譜-四極杆/飛行時(shí)間質譜)的綜合化學(xué)表征,采用網絡直播資源藥理學(xué)方法預測RG對(duì)CAG的潛在有效成(chéng)分和核心靶姑娘中文版點。進(jìn)一步采用CAG動物模型驗證其藥效學(xué),結合代謝組學(xué)GOTV、16S rRNA測序、Met origin代謝物溯源分析和分子對(duì)接等方法分析盲腸内容免費在線物腸道(dào)菌群,并探讨其基于合并策略的CAG對(duì)抗機制動漫大地。網絡藥理學(xué)首次預測RG的療效歸因于4種(zhǒng丁香花在線)有效成(chéng)分和7個靶點。CAG大鼠盲腸内容物的代謝組學(xué)結合M高清免費et origin溯源分析研究發(fā)現,初級膽汁酸生物合成(姑娘姑娘chéng)是其與腸道(dào)微生物群代謝相關的靶向(xiàng)代謝通路。在線TV16S rRNA測序表明,RG通過(guò)調節腸道(dào)直播影院微生物群的失衡來治療CAG。分子對(duì)接進(jìn)一步證實,RG的有效成(chéng)分中文版姑娘可以對(duì)潛在靶點、同源性分析途徑和腸道(dào)微生物群代謝途徑的關鍵酶進(jìn影院GO)行幹預。

 

推薦語

結果表明,RG對(duì)CAG有良好(hǎo)的作用。其中槲動漫藝術皮素、山奈酚、油酸和表兒茶素4種(zhǒng)活性成(chéng姐姐高清)分是發(fā)揮藥物作用的關鍵,可針對(duì)CAG的核心姐姐MV靶點、初級膽汁酸生物合成(chéng)和腸道(dào)菌群代謝途徑進(j影院資源ìn)行幹預。

 


 

标題:An early-life microbiota metabolite protects成全成全 against obesity by regulating intestinal l免費姐姐ipid metabolism

譯名:一種(zhǒng)早期微生物群代謝産物通過(guò)調節腸道(dào)脂質動漫美麗代謝來預防肥胖

作者:Catherine D Shelton等

時(shí)間:2023-10-03

期刊:Cell Host & Microbe

影響因子:30.3

DOI:10.1016/j.chom.2023.09.002

 

 

摘要

早期生命微生物群保護兒童免受促進(jìn)兒童肥胖的環境因素的機制在很大程度上仍藝術姐姐然未知。在小鼠模型中,幼鼠同時(shí)暴露于抗生素和高脂肪(HF)飲食,研究表明小腸(SI)微生在線姐姐物群的主要成(chéng)員乳酸杆菌生命早期調節腸上皮細胞(IECs)以限成全動漫制飲食誘導的肥胖。乳酸杆菌衍生的代謝物苯乳酸(PLA)通過(guò)增加SI IECs中過TVGO(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(PPAR-γ)的豐度,來防姑娘直播止早期暴露于抗生素和HF飲食引起(qǐ)的代謝功能(néng)障礙。因此,苯乳酸是一種(zhǒ視頻丁香花ng)微生物群衍生的代謝物,可激活小腸上皮中的保護途徑,以調節腸道(dào)脂質代謝動漫在線,預防生命早期抗生素相關性肥胖。

 

推薦語

該研究表明,PLA上調了腸道(dào)PPAR-γ,并防止因早年接觸抗生姐姐TV素和HF飲食引起(qǐ)的代謝功能(néng)障礙。因此,PLA是一種(zhǒng)微生物中文版成全群衍生的代謝物,可激活SI上皮的保護途徑,以防止生命早期肥胖。

 


 

标題:Mefentrifluconazole exposure disrupte國語藝術d hepatic lipid metabolism disor成全直播der tightly associated with gut barrier function好姑娘藝術 abnormal in mice

譯名:甲氟康唑暴露引起(qǐ)小鼠肝脂代謝紊亂與腸道(dào)屏障功能(néng)異常密切高清版動漫相關

作者:Hu Zhang等

時(shí)間:2023-09-23

期刊:Science of the Total Environment

影響因子:9.8

DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.167317

 

 

摘要

甲氟康唑(Mefentrifluconazole, MFZ)是一種(zh免費視頻ǒng)用于防治農業真菌危害的唑類殺菌劑。然而,由于其非生物降解性,唑類殺菌劑可在植物高清版成全、動物和環境中積累,從而成(chéng)為世界範圍内的主要健康問題。本研究將(jiā在線成全ng)7周齡的C57BL/6小鼠暴露于10、30和100 mg/kg的MFZ 28天,以評估MF直播藝術Z對(duì)小鼠肝髒和腸道(dào)組織的毒性作用。組織病理學(xué)、生化指國語國語标和轉錄組分析表明,MFZ暴露擾亂了小鼠肝髒結構和肝髒脂質代謝,破壞了腸道(dào)屏障功動漫成全能(néng)并促進(jìn)炎症反應。此外,16S rRNA測序結果表明,MFZ暴露在免費姑娘屬水平上顯著增加了patescibacteria的豐度。此外,大地高清MFZ暴露增加了與糖脂代謝抑制相關的細菌屬的豐度。這(zhè)些結果提示,MFZ姑娘成全暴露導緻的肝髒脂質代謝紊亂可能(néng)是由腸道(dào)菌群功能(néng)的改變丁香花TV引起(qǐ)的。本研究為MFZ的發(fā)病風險評估提供了新飄雪丁香花的研究思路,同時(shí)也加強了對(duì)新型殺菌劑的關注。

 

推薦語

本研究指出MFZ破壞小鼠的肝脂代謝、降低小鼠肝脂代謝相關基因的表達、誘導小鼠腸屏障功能(néng姐姐美麗)障礙、導緻小鼠腸道(dào)微生物群失調。這(zhè)為MFZ的發(fā)病風高清視頻險評估提供了新的研究思路,同時(shí)也加強了對(duì)新型殺菌劑的關注。

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